Conseiller régional d’Alsace de 1986 à 1989 et de 1992 à 1998
Candidat aux élections présidentielles de 1988, il obtient 3,88%
Tête de liste aux élections européennes de 89, il obtient 10,5% et 9 sièges
Conseiller Municipal de Mulhouse de 1989 à 1994
Député européen de 1989 à 1991
En 1992, Laurent Fabius lui propose le Ministère de l’Aménagement du territoire et de l’Environnement, Antoine Waechter soumet sa décision aux Verts qui votent un refus.
1994 : Quiite les Verts, et fonde le MEI, Mouvement Ecologiste Indépendant